המשרד להגנת הסביבה אחראי לניסוחה של מדיניות ארצית משולבת וכוללנית, וכן לפיתוח אסטרטגיות, תקנים וקדימויות להגנת הסביבה. במישור זה פועלים במשרד אגפים ומחלקות העוסקים בטיפול בנושאים הסביבתיים המקצועיים, במנגנון האדמיניסטרטיבי ובקשרי גומלין עם האזרח.
המשרד להגנת הסביבה שותף לתכנית Israel NewTech בשני רבדי פעילות עיקריים:
פיתוח המשאב האנושי- למשרד להגנת הסביבה ישנו תקציב ייעודי לתמיכה במחקרים אקדמיים בתחומי סביבה שונים לרבות היבטי אקולוגיה, מים, אנרגיה מתחדשת והתייעלות אנרגטית, פסולת, תחליפי נפט לתחבורה, בנייה ירוקה ועוד.